次氯酸鈉發生器的主要結構包括水軟化裝置、溶鹽裝置、電解裝置、控制裝置、儲藥裝置和加藥裝置。其中，水軟化裝置負責將水質軟化到適合電解的硬度，并減少主電解槽中的水垢輸出。鹽溶解裝置負責將軟化水與鹽混合以產生低濃度鹽水。電解裝置負責將配制好的低濃度鹽水電解成次氯酸鈉消毒劑。控制裝置、儲藥裝置和加藥裝置是保證設備正常運行的重要部件。
當設備啟動時，動力水將通過水管流入水軟化裝置，水軟化裝置中的水質硬度將降低。達到理想的電解水硬度后，在鹽水溶解裝置中用食用鹽溶解，制得低濃度鹽水。這些制備的低濃度鹽水將通過管道輸送到電解槽，次氯酸鈉消毒劑將在電解槽中電解生產。次氯酸鈉發生器采用無隔膜電解法，制造成本低，藥品生產效率高，維護簡便。電解裝置制備的次氯酸鈉消毒劑由投藥裝置投入指定的投藥點。
在設備電解過程中電解槽發生的反應原理如下：
陽極反應：2C1<sup>-</sup>-2e→C1<sub>2</sub>↑
陰極反應：2Na<sup>+</sup>+2H<sub>2</sub>O+2e→H<sub>2</sub>↑+2NaOH
溶液反應：Cl<sub>2</sub>+2NaOH→NaCl+NaClO+H<sub>2</sub>O
總反應：NaCl+H<sub>2</sub>O→NaClO+H<sub>2</sub>↑
